بی کربنات آمونیوم یک معرف متداول برای فرآیندهای صنعتی و تحقیقاتی است.بی کربنات آمونیوم در محلول فرار است و آمونیاک و CO2 آزاد می کند.این خاصیت بی کربنات آمونیوم را به یک بافر خوب برای کاربردهایی مانند لیوفیلیزاسیون و دفع لیزر به کمک ماتریکس تبدیل می کند.بی کربنات آمونیوم همچنین برای هضم ژل پروتئین ها توسط تریپسین و در تجزیه و تحلیل طیف سنجی جرمی MALDI پروتئین ها استفاده می شود.